法醫學的誕生和發展，與社會經濟的發展、法的出現、以及醫學和其他自然科學的進步有著密切的關系。法醫學的歷史大體可以分為三個時期，即萌芽時期、形成時期、發展和成熟時期。

    萌芽時期中國先秦時期就有了損傷檢驗，《禮記·月令》中記載“孟秋之月，……命理瞻傷、察創、視折、審斷，決獄訟，必端平”。在已發掘的秦墓竹簡中，亦有他殺、殺嬰、自縊、外傷性流產等檢驗案例的記載。戰國末期還有“令史”專門從事尸體檢驗和活體檢驗。

    形成時期約為公元11～19世紀，這時社會經濟得到進一步的發展，法制趨向健全，案件的鑒定有專業醫生參與，開始有較系統的法醫著作出現。這時期有代表性的著作是中國南宋理宗淳祜七年(1247)湖南提點刑獄宋慈編著的《洗冤集錄》五卷。內容包括：檢驗總說、疑難雜說、初檢、復檢、驗尸、四時變動、驗骨、自縊，溺死、自刑、殺傷、火死、跌死、服毒及其他各種死共53項。這是世界上早的一部系統法醫學著作，曾被譯成多種文字在許多國家出版。

    發展和成熟時期，工業革命給科學技術的發展，開辟了廣闊的前景。18世紀以前的法醫學主要靠肉眼觀察活體、尸體現象，所得到的是直觀的、淺顯的結論，19世紀后則由于顯微鏡技術的出現和化學分析方法的應用，法醫學的研究工作得到深入發展。

    20世紀以來，經濟的發展和自然科學的突飛猛進大大促進了法醫學的發展，現代分析儀器的運用和新檢驗技術的應用，標志著現代法醫學體系的形成。

    基礎醫學與法醫學院是濟寧醫學院大的教學單位，承擔著全校臨床醫學、預防醫學、口腔醫學、醫學影像學、法醫學、護理學、醫學檢驗、康復治療學、應用心理學等專業醫學基礎課程的教學任務。近五年來在國內外學術期期刊發表論文500余篇，出版著作40余部，承擔省級以上課題30余項。學院以科學發展觀為指導，以教學質量為中心，加強內涵建設，全面提高教育教學質量，努力建設成為教學水平高、綜合科研實力強、專業特色鮮明的二級學院。